生物與環(huán)境工程學(xué)院下設(shè)生物化工、環(huán)境工程、食品科學(xué)、發(fā)酵工程和微生物學(xué)5個學(xué)科，其中生物化工和環(huán)境工程分別是浙江省重點(diǎn)扶植學(xué)科和學(xué)校重點(diǎn)學(xué)科。擁有生物化工、發(fā)酵工程和環(huán)境工程3個碩士點(diǎn)，生物工程、生物技術(shù)、環(huán)境工程、食品科學(xué)與工程及制藥工程(生物制藥)五個本科專業(yè)，還培養(yǎng)環(huán)境工程、生物化工專業(yè)的工程碩士。現(xiàn)有教職工近60人，其中中國工程院院士1人、教授7人、博士近10人。

　　學(xué)院倡導(dǎo)“求實(shí)、創(chuàng)新”的院風(fēng)。在人才培養(yǎng)方面，注重基礎(chǔ)理論教育和實(shí)踐能力培養(yǎng)，形成了碩士生和工程碩士生、研究生、本科生及大專生等多層次的培養(yǎng)體系，歷屆畢業(yè)生大多數(shù)已在有關(guān)工廠及科研、教育等企事業(yè)單位發(fā)揮著重要的骨干作用。學(xué)院旨在振興和發(fā)展本省經(jīng)濟(jì)，培養(yǎng)理論與實(shí)踐相結(jié)合的全面發(fā)展的生物工程、生物技術(shù)、環(huán)境工程、食品科學(xué)與工程以及生物制藥等領(lǐng)域的高級技術(shù)人才。

　　在科學(xué)研究和工程開發(fā)方面，生物化工學(xué)科主要開展生物細(xì)胞大規(guī)模培養(yǎng)、生物反應(yīng)過程的研究、生物產(chǎn)物分離與純化、新酶種的開發(fā)與應(yīng)用、新生物醫(yī)藥品和生物農(nóng)藥品的研制以及化學(xué)品化學(xué)結(jié)構(gòu)的生物法改造、生物反應(yīng)過程裝備等研究開發(fā)工作，承擔(dān)國家攻關(guān)、省重大攻關(guān)等一系列項(xiàng)目，在微生物轉(zhuǎn)化法生產(chǎn)大宗化工原料、微生物源生物農(nóng)藥、生物制藥、生物過程裝備等方面處于國際先進(jìn)或國內(nèi)領(lǐng)先水平，獲得國家科技二等獎、浙江省科技進(jìn)步獎等獎項(xiàng)多項(xiàng)。發(fā)酵工程學(xué)科主要開展微生物菌種的篩選、用基因工程手段改良微生物菌株、酶制劑的生產(chǎn)與應(yīng)用、食品與食品添加劑的生物法生產(chǎn)、生物活性物質(zhì)的提取與純化、環(huán)境生物技術(shù)等方面的研究工作，承擔(dān)了省自然科學(xué)基金、國家環(huán)保局等一大批項(xiàng)目，在酶與細(xì)胞的固定化技術(shù)、產(chǎn)酶菌株的發(fā)現(xiàn)與改良、發(fā)酵工藝過程的優(yōu)化與控制等方面處于國內(nèi)領(lǐng)先或先進(jìn)水平。

　　獲得過浙江省科技進(jìn)步二等獎等獎項(xiàng)多項(xiàng)。環(huán)境工程學(xué)科主要開展水和大氣污染控制、固廢物處置新技術(shù)的研究和開發(fā)，以及噪聲治理、環(huán)境影響評價工作，承擔(dān)了一批國際合作和國家基金等項(xiàng)目的研究，在“環(huán)境中污染物的生物降解”、“廢水的超臨界法處理”等研究領(lǐng)域分別處于國內(nèi)領(lǐng)先和國內(nèi)先進(jìn)水平，持有廢水、廢氣治理工程乙級證書和建設(shè)項(xiàng)目環(huán)評乙級證書。食品科學(xué)學(xué)科主要開展食品加工用的新酶種生產(chǎn)、發(fā)酵法生產(chǎn)食品與食品添加劑、植物細(xì)胞培養(yǎng)生產(chǎn)營養(yǎng)功能食品、酶法加工食品、食品加工中的分離工程技術(shù)、食品新營養(yǎng)功能資源的研究、食品資源深度加工利用、食品資源功能成分的研究。承擔(dān)了省自然科學(xué)基金、省重點(diǎn)科研項(xiàng)目及工廠委托的一大批研究項(xiàng)目，取得了包括省政府科技進(jìn)步獎等一系列成果。微生物學(xué)學(xué)科主要開展基因工程技術(shù)及應(yīng)用的研究，培育各類工業(yè)微生物生產(chǎn)菌種篩選、工業(yè)“三廢”降解菌及土壤再生菌。承擔(dān)了一批省部級項(xiàng)目，取得了一批國內(nèi)領(lǐng)先的成果，在國內(nèi)外知名雜志上發(fā)表了一批學(xué)術(shù)水平較高的論文。學(xué)院在這五個學(xué)科領(lǐng)域開展了大量的研究工作，2000年科研項(xiàng)目總經(jīng)費(fèi)470萬元;近五年發(fā)表的論文被SCI、EI收錄17篇次、獲省部二、三等獎7次;科研成果得到推廣應(yīng)用，為浙江省的生物化工、環(huán)保、食品、制藥等行業(yè)的發(fā)展作出了較大貢獻(xiàn)。

　　學(xué)院下屬五個研究所，分別是生物工程研究所、環(huán)境科學(xué)與工程研究所、營養(yǎng)食品研究所、發(fā)酵工程研究所、釀酒研究所;下屬一個發(fā)酵工學(xué)中試車間(與日本Santury公司聯(lián)建)和一個省級制藥工程研究中心。