1985年，經(jīng)原國(guó)家教委教研司011號(hào)文件批準(zhǔn)，我校政治經(jīng)濟(jì)學(xué)（特區(qū)經(jīng)濟(jì)）和企業(yè)管理專業(yè)開始招收碩士研究生，至1988年共招收4屆19名碩士研究生。1993年至1996年，我校政治經(jīng)濟(jì)學(xué)、中國(guó)古代文學(xué)、馬克思主義哲學(xué)、建筑設(shè)計(jì)及其理論4個(gè)專業(yè)分別與華南師范大學(xué)、華南理工大學(xué)聯(lián)合培養(yǎng)碩士生研究生共10人。

　　1996年，我校正式獲得碩士學(xué)位單位授予權(quán)，同時(shí)3個(gè)學(xué)科、專業(yè)獲得授權(quán)。之后，全校上下團(tuán)結(jié)、努力，不斷加強(qiáng)學(xué)科、學(xué)位點(diǎn)建設(shè)，至2011年，我校已擁有3個(gè)博士授權(quán)一級(jí)學(xué)科，25個(gè)碩士授權(quán)一級(jí)學(xué)科，另有15個(gè)碩士授權(quán)二級(jí)學(xué)科。

　　目前，在校研究生3300余名，根據(jù)學(xué)校“十二五”規(guī)劃目標(biāo)，2015年在校研究生將達(dá)5000名。 我校師資力量雄厚，現(xiàn)有碩士生導(dǎo)師812 位，博士生導(dǎo)師27人。為提高學(xué)校整體科研水平，提高培養(yǎng)質(zhì)量，學(xué)校引進(jìn)了以牛憨笨院士、倪家纘院士、陳國(guó)良院士為代表的一批高水平學(xué)科帶頭人，并為他們提供優(yōu)良的工作條件，組建了學(xué)術(shù)梯隊(duì)。最近，又聘請(qǐng)劉盛綱、陳俊亮、錢清泉等8位院士為我校“雙聘”院士。

　　為充分發(fā)揮我校高層次教育的社會(huì)作用，學(xué)校采取多種形式，加大對(duì)社會(huì)人才的繼續(xù)培養(yǎng)。學(xué)校于2000年開始舉辦研究生課程進(jìn)修班，多年來，有數(shù)千人才參加了研究生課程學(xué)習(xí)；數(shù)百人通過同等學(xué)力人員申請(qǐng)碩士學(xué)位全國(guó)統(tǒng)考和學(xué)位論文答辯，獲得碩士學(xué)位。

　　2005年，我校獲工程碩士專業(yè)學(xué)位授權(quán)，現(xiàn)已在電子與通訊工程、建筑與土木工程、集成電路、機(jī)械工程四個(gè)專業(yè)領(lǐng)域招生。近年來，專業(yè)學(xué)位碩士發(fā)展迅速，目前我校已擁有包括MBA、MPA、教育碩士、法律碩士等21個(gè)專業(yè)學(xué)位點(diǎn)（培養(yǎng)領(lǐng)域）。

　　隨著我校研究生教育規(guī)模的擴(kuò)大，加強(qiáng)管理、保證培養(yǎng)質(zhì)量就成為我們的工作關(guān)鍵。為此，學(xué)校在增加投資力度，加強(qiáng)學(xué)科建設(shè)、學(xué)位點(diǎn)建設(shè)的同時(shí)，不斷健全研究生教育的管理機(jī)構(gòu)，充實(shí)管理隊(duì)伍，完善各類規(guī)章制度。2010年12月，深圳大學(xué)研究生部更名為研究生院（籌），下設(shè)培養(yǎng)管理辦公室、學(xué)位辦公室、學(xué)生工作辦公室等工作部門，學(xué)位與研究生教育工作進(jìn)一步得到加強(qiáng)。