中醫(yī)系成立于2004年軍隊(duì)編制體制調(diào)整之際，目前已躋身國(guó)家教育部中西醫(yī)結(jié)合重點(diǎn)學(xué)科二期建設(shè)、國(guó)家“211工程”重點(diǎn)學(xué)科三期建設(shè)。是解放軍中醫(yī)腫瘤研究所、上海市綜合性醫(yī)院示范中醫(yī)科、國(guó)家中醫(yī)藥管理局三級(jí)實(shí)驗(yàn)室、中西醫(yī)結(jié)合博士后流動(dòng)站，博士、碩士、本科生培養(yǎng)點(diǎn)，也是軍隊(duì)唯一承擔(dān)中醫(yī)外訓(xùn)任務(wù)的單位。 學(xué)科已形成以中西醫(yī)結(jié)合防治腫瘤、糖尿病、婦科病為特色、學(xué)科全面發(fā)展的格局。學(xué)科帶頭人擔(dān)任中國(guó)中西醫(yī)結(jié)合學(xué)會(huì)副會(huì)長(zhǎng)、軍隊(duì)中醫(yī)藥學(xué)會(huì)副會(huì)長(zhǎng)、上海市中西醫(yī)結(jié)合學(xué)會(huì)副會(huì)長(zhǎng)等職。先后有2人進(jìn)入軍隊(duì)“拜院士為師”中醫(yī)藥學(xué)科帶頭人培養(yǎng)計(jì)劃，1人獲批總后科技銀星，1人進(jìn)入上海市醫(yī)學(xué)領(lǐng)軍人才培養(yǎng)計(jì)劃，5人次當(dāng)選為國(guó)家和軍隊(duì)各級(jí)學(xué)會(huì)會(huì)長(zhǎng)、副會(huì)長(zhǎng)，已擁有國(guó)家杰出青年基金獲得者、軍隊(duì)中醫(yī)藥“國(guó)醫(yī)名師”、上海市名中醫(yī)、學(xué)校特級(jí)教員各1名，學(xué)校A級(jí)教員7名，優(yōu)秀本科生導(dǎo)師5名。 4人入選上海市青年科技啟明星培養(yǎng)計(jì)劃，承擔(dān)包括國(guó)家科技部重大專項(xiàng)課題、國(guó)家自然科學(xué)基金重點(diǎn)項(xiàng)目及重大國(guó)際合作項(xiàng)目、國(guó)家科技部“十一五”支撐計(jì)劃、軍隊(duì)“十一五”軍事專項(xiàng)、上海市基礎(chǔ)重點(diǎn)課題在內(nèi)的科研項(xiàng)目70項(xiàng)，總科研經(jīng)費(fèi)2485.8萬(wàn)元。在國(guó)際學(xué)術(shù)交流方面先后與美國(guó)、德國(guó)、澳大利亞等國(guó)的4個(gè)學(xué)校和研究所建立了長(zhǎng)期的學(xué)術(shù)交流與科研合作關(guān)系。 本學(xué)科先后招收中西醫(yī)結(jié)合專業(yè)博士生42名、碩士生91名，研究生教育培養(yǎng)質(zhì)量水平高。已畢業(yè)的26名博士生中，先后有12人走上了科主任工作崗位，有3名博士生、1名碩士生進(jìn)入上海市青年科技啟明星人才培養(yǎng)計(jì)劃，3名博士生進(jìn)入上海市優(yōu)秀青年醫(yī)學(xué)人才培養(yǎng)計(jì)劃，3名留校博士生被評(píng)為我校A級(jí)優(yōu)秀教員。