東南大學公共衛(wèi)生學院，建立于1976年，其前身為鐵道部所屬的原南京鐵道醫(yī)學院預防醫(yī)學系，1999年更名為南京鐵道醫(yī)學院公共衛(wèi)生學院，是全國鐵路系統(tǒng)衛(wèi)生防疫工作人才培養(yǎng)和科學研究的重要基地。2000年4月，南京鐵道醫(yī)學院與教育部直屬的重點大學----東南大學合并，組建新的東南大學，公共衛(wèi)生學院成為東南大學下設的二級院系之一。
　　公共衛(wèi)生學院現(xiàn)設有預防醫(yī)學和勞動與社會保障（醫(yī)療保險專業(yè)方向）2個本科專業(yè)。建有“公共衛(wèi)生與預防醫(yī)學”一級學科博士點；“公共衛(wèi)生與預防醫(yī)學”博士后科研流動站；也是教育部批準的首批開展公共衛(wèi)生碩士（MPH）培養(yǎng)試點單位之一。勞動與社會保障專業(yè)（醫(yī)療保險專業(yè)方向），是江蘇省教育廳批準的省重點建設的特色專業(yè)，現(xiàn)設有社會保障學碩士點。
　　學院設有勞動衛(wèi)生與環(huán)境衛(wèi)生學、營養(yǎng)與食品衛(wèi)生學、流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計學和醫(yī)療保險學等4個學科系；預防醫(yī)學、站車衛(wèi)生、醫(yī)療保險、醫(yī)學應用技術、傷害流行病學等5個研究所。“公共衛(wèi)生與預防醫(yī)學”一級學科為江蘇省一級學科重點學科，此外還有2個鐵道部重點學科，1個與省CDC共建的重點實驗室。
　　學院擁有一支素質(zhì)優(yōu)良，數(shù)量、結構合理的師資隊伍。教師中，現(xiàn)有博士生導師7人，教授（研究員）13人，副教授20人，其中擔任國家自然基金評審委員2人，教育部專業(yè)指導委員會委員2人，江蘇省333工程領軍人才2人，全國高校優(yōu)秀骨干教師1人，衛(wèi)生部國家食品安全風險評估專家委員會委員1人。具有博士學位和在讀博士學位的教師占到教師總數(shù)的80%以上，一半以上的教師具有海外留學或研修的經(jīng)歷，此外學院還在國內(nèi)外著名專家學者中聘請了一批兼職教授、客座教授，在省市一級重點疾控中心聘請了十余位基地研究生導師。
　　學院秉承百年名校—東南大學“止于至善”的辦學理念，發(fā)揮東南大學以工為主，文理管醫(yī)藝多學科的資源優(yōu)勢，積極探索走醫(yī)工結合、精而強的特色發(fā)展之路，近幾年來，學院適當控制本科生招生規(guī)模，大力發(fā)展研究生教育，不斷提高辦學層次和辦學水平，現(xiàn)有在校本科生約430人，博士、碩士研究生130人（不包括專業(yè)碩士）。在加強人才培養(yǎng)的同時，學院注重圍繞國家和區(qū)域經(jīng)濟社會發(fā)展的公共衛(wèi)生重大問題，積極開展科學研究，重點在環(huán)境與健康、納米毒理、太湖水環(huán)境治理、健康膳食干預、重大傳染病防治以及衛(wèi)生政策研究等方面形成了穩(wěn)定的研究方向。目前承擔有國家973、863計劃、國家自然基金，衛(wèi)生部重大專項、科技部支撐計劃以及省自然基金和國際合作課題等40余項。近五年來，獲得縱向科研經(jīng)費3000余萬元。
　　學院擁有教學科研用房6000余平方米，建有教學實驗中心、計算機中心和分析檢測中心以及SPF動物實驗室等，并建有“環(huán)境醫(yī)學工程”教育部重點實驗室和衛(wèi)生部批準的保健功能食品檢驗單位。
　　學院積極開展國內(nèi)外的學術交流，先后邀請美國、德國、澳大利亞以及香港、臺灣等國家和地區(qū)的多所高校的著名專家學者來院訪問交流，并積極選派青年教師前往國外著名高校訪問研修，與香港大學公共衛(wèi)生學院建立了院際交流合作關系，與澳大利亞莫納什大學公共衛(wèi)生學院在聯(lián)合培養(yǎng)方面開展了密切合作。
　　2009年，在教育部組織的全國高校與科研院所一級學科評估排名中，學院“公共衛(wèi)生與預防醫(yī)學”一級學科位列第9位。