2000年4月，根據(jù)國(guó)家高等教育管理體制改革和結(jié)構(gòu)調(diào)整的總體要求，由原中南工業(yè)大學(xué)、湖南醫(yī)科大學(xué)、長(zhǎng)沙鐵道學(xué)院合并組建直屬教育部的中南大學(xué)。學(xué)校組建后，根據(jù)學(xué)科門類的特點(diǎn)，按照資源共享、調(diào)整、合并的原則，2002年4月將原湘雅醫(yī)學(xué)院藥學(xué)系、基礎(chǔ)與臨床藥理研究所，第一、第二、第三臨床學(xué)院藥劑學(xué)學(xué)科調(diào)整組合成立中南大學(xué)藥學(xué)院。學(xué)院現(xiàn)設(shè)8個(gè)教學(xué)機(jī)構(gòu)，2個(gè)科研機(jī)構(gòu)。其中，心血管研究實(shí)驗(yàn)室是湖南省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、分子設(shè)計(jì)及藥物發(fā)現(xiàn)研究所是湖南省首家以計(jì)算機(jī)為工具進(jìn)行藥物設(shè)計(jì)與開(kāi)發(fā)的科研機(jī)構(gòu)。
　　學(xué)院現(xiàn)有教職員工54人，引進(jìn)了“升華學(xué)者”4人。專任教師博士比達(dá)到41%。博士生導(dǎo)師14人，碩士生導(dǎo)師26人；有國(guó)家級(jí)新藥評(píng)審專家2人， 省級(jí)新藥評(píng)審專家10人；中國(guó)工程院彭司勛院士為榮譽(yù)教授 。
　　藥理學(xué)是國(guó)家重點(diǎn)學(xué)科 ，國(guó)家精品課程。藥理學(xué)科是國(guó)家最早獲得博士學(xué)位和碩士學(xué)位授予權(quán)的學(xué)科之一。其畢業(yè)研究生已獲得全國(guó)優(yōu)秀博士學(xué)位論文2篇，提名4篇。
　　藥學(xué)專業(yè)2005年成為湖南省重點(diǎn)專業(yè)；藥物化學(xué)和《臨床藥學(xué)》分別是學(xué)校重點(diǎn)專業(yè)和建設(shè)精品課程。在 2004、2009年全國(guó)藥學(xué)一級(jí)學(xué)科兩次評(píng)估中，中南大學(xué)藥學(xué)學(xué)科排名全國(guó)第6位和并列第7位。現(xiàn)有藥理學(xué)博士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)1個(gè)，藥理學(xué)、藥劑學(xué)、藥物化學(xué)和生藥學(xué)碩士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)4個(gè)。藥學(xué)學(xué)科是國(guó)家確定的博士后科研流動(dòng)工作站。
　　藥學(xué)院是國(guó)家食品藥品監(jiān)督管理局首批審核確定的執(zhí)業(yè)藥師繼續(xù)教育規(guī)范化培訓(xùn)基地；2002年，經(jīng)教育部備案，湖南省教委審核批準(zhǔn)，藥學(xué)院成為藥學(xué)專業(yè)（獨(dú)立本科段）自學(xué)考試主考單位。經(jīng)過(guò)10年的建設(shè)和發(fā)展，中南大學(xué)藥學(xué)院已初步形成了具有全日制本科教育、研究生教育、博士后培養(yǎng)、成人教育，執(zhí)業(yè)藥師繼續(xù)教育等較為完整的教學(xué)體系。
　　學(xué)院堅(jiān)持以“創(chuàng)辦藥學(xué)精品專業(yè)”為理念。除1997、1998年招收本科學(xué)生30人外，此后每年招收本科學(xué)生保持60人左右。研究生招生規(guī)模穩(wěn)步增長(zhǎng)，自2007年開(kāi)始，碩士研究生招生人數(shù)已經(jīng)超過(guò)來(lái)本科生規(guī)模，09年招收碩士研究生達(dá)到70人，博士研究生8人。目前在校本科學(xué)生240人；在讀碩士生144人，博士生30人，研究生課程班學(xué)員60人，本科自考學(xué)員300人；在站博士后4人。
　　學(xué)院自2002年以來(lái)承擔(dān)包括國(guó)家自然科學(xué)基金面上、重大項(xiàng)目在內(nèi)的各類科研項(xiàng)目130余項(xiàng)，教師人年均科研經(jīng)費(fèi)超過(guò)20萬(wàn)元；在國(guó)內(nèi)外各級(jí)期刊雜志發(fā)表科研、教改論文400篇，其中被SCI收錄的科研論文達(dá)130篇；編撰包括研究生、本科生和大中專學(xué)生在內(nèi)使用的規(guī)劃統(tǒng)編教材、學(xué)術(shù)專著和科研教學(xué)參考書50多部； 獲中華醫(yī)學(xué)科技二等獎(jiǎng)、三等獎(jiǎng)各1項(xiàng)，教育部科技進(jìn)步一等獎(jiǎng)、衛(wèi)生部科技進(jìn)步二等獎(jiǎng)、湖南省科技進(jìn)步獎(jiǎng)等其他省部級(jí)科研成果獎(jiǎng)多項(xiàng)；與企業(yè)合作完成四個(gè)國(guó)家二類新藥、三個(gè)國(guó)家四類新藥共計(jì)100余個(gè)品種的新藥研制報(bào)批工作；申請(qǐng)國(guó)家發(fā)明專利20項(xiàng)，獲得授權(quán)發(fā)明專利2項(xiàng)；獲省部級(jí)教學(xué)成果獎(jiǎng)多項(xiàng)。研究生成績(jī)尤為喜人，獲全國(guó)優(yōu)秀博士學(xué)位論文獎(jiǎng)2人，全國(guó)優(yōu)秀博士學(xué)位論文提名獎(jiǎng)4人，全國(guó)三好學(xué)生1人，湖南省優(yōu)秀博士學(xué)位論文8人，湖南省優(yōu)秀碩士學(xué)位論文10人，中國(guó)藥理學(xué)會(huì)Servier青年藥理學(xué)工作者獎(jiǎng)5人等多項(xiàng)獎(jiǎng)勵(lì)。
　　藥學(xué)院以國(guó)家重點(diǎn)學(xué)科為依托，形成了一支勇于奉獻(xiàn)、勤奮敬業(yè)、務(wù)實(shí)創(chuàng)新的學(xué)科團(tuán)隊(duì)；建立了一個(gè)集教學(xué)、科研于一體的創(chuàng)新實(shí)驗(yàn)平臺(tái)。近年來(lái)，學(xué)院投入較大力量研究中藥有效藥理成分，尋找先導(dǎo)化合物，以其開(kāi)發(fā)具有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的新藥。李元建教授領(lǐng)導(dǎo)的課題組發(fā)現(xiàn)中藥吳茱萸中重要藥理活性成分吳茱萸次堿單次靜脈注射能顯著降低高血壓動(dòng)物血壓，長(zhǎng)期口服能產(chǎn)生穩(wěn)定的降壓作用，其降壓作用與促進(jìn)降鈣素基因相關(guān)肽釋放與合成有關(guān)。該項(xiàng)目已完成化學(xué)合成，正按新藥指南加緊臨床前藥學(xué)、藥理學(xué)的研究，有望研發(fā)出具有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的I類新藥。該發(fā)現(xiàn)已申請(qǐng)國(guó)家專利并獲得國(guó)家自然科學(xué)基金重大項(xiàng)目資助。以譚桂山教授為首的課題小組從湖南湘西、四川川東地區(qū)獐牙菜中分離、提純多種具有藥理活性的山酮類化合物，發(fā)現(xiàn)其中3種新化合物具有抗炎、保護(hù)血管內(nèi)皮細(xì)胞的作用，已有9篇研究論文發(fā)表于國(guó)際知名刊物，引起國(guó)內(nèi)外同行的普遍關(guān)注，該研究正按中藥Ⅱ類新藥研發(fā)為抗動(dòng)脈粥樣硬化藥物。
　　藥學(xué)院與“湖南達(dá)嘉維康醫(yī)藥有限公司”等知名企業(yè)合作設(shè)立優(yōu)秀本科學(xué)生獎(jiǎng)學(xué)金，與廣州威爾曼新藥研發(fā)中心有限公司合作設(shè)立“孫明杰優(yōu)秀研究生”獎(jiǎng)學(xué)金。與湖南漢森醫(yī)藥醫(yī)藥有限公司建立了湖南省產(chǎn)學(xué)研示范基地。與麓谷醫(yī)藥有限公司等數(shù)家知名企業(yè)簽署了戰(zhàn)略合作協(xié)議。
　　我院將始終瞄準(zhǔn)生物醫(yī)藥的前沿領(lǐng)域，面向國(guó)內(nèi)醫(yī)藥工業(yè)的主戰(zhàn)場(chǎng)，進(jìn)一步加強(qiáng)同國(guó)內(nèi)外科研機(jī)構(gòu)、醫(yī)藥工業(yè)企業(yè)的交流與合作，堅(jiān)持科學(xué)研究與社會(huì)服務(wù)同步發(fā)展的辦院方針；積極創(chuàng)造條件與國(guó)際高等藥學(xué)教育接軌，逐步向六年制藥學(xué)專業(yè)轉(zhuǎn)化；全面開(kāi)放，走產(chǎn)、學(xué)、研相結(jié)合的專業(yè)建設(shè)道路，努力將中南大學(xué)藥學(xué)院建設(shè)成國(guó)內(nèi)領(lǐng)先、國(guó)際有較大影響的高層次藥學(xué)專業(yè)人才的培養(yǎng)基地。
　　現(xiàn)任院黨總支書記彭林教授，院長(zhǎng)李元建教授，副院長(zhǎng)譚桂山教授、程澤能教授。