企業(yè)績效管理通常存在一些問題，這些問題主要包括：
(1)對績效管理的認識存在誤區(qū)
簡單的把績效考核認為就是績效管理。事實上績效管理是由績效計劃制定、績效輔導實施、績效考核評價、績效結(jié)果反饋組成的一個循環(huán)，而績效考核只是績效管理的一個環(huán)節(jié)。
(2)績效管理與企業(yè)戰(zhàn)略脫節(jié)
企業(yè)戰(zhàn)略本身缺乏可執(zhí)行性和可持續(xù)性，缺乏由戰(zhàn)略到執(zhí)行的閉環(huán)式戰(zhàn)略管理流程。企業(yè)的經(jīng)營目標、日常活動未與戰(zhàn)略目標緊密銜接�？冃繕说膩碓赐皇瞧髽I(yè)戰(zhàn)略。其實，無論是業(yè)務(wù)部門，還是支持部門，隨著企業(yè)戰(zhàn)略的不斷調(diào)整，其績效目標也是不斷變化的。
(3)企業(yè)文化方面的缺陷
很少一些企業(yè)文化建設(shè)比較成功的以外，大多數(shù)企業(yè)文化準備不充分，這導致了與績效管理要求的企業(yè)文化準備之間差距非常大在企業(yè)的愿景，使命，核心價值及戰(zhàn)略定義等，還沒有完全清晰解決之前，建立績效管理系統(tǒng)是無效的。
(4)傳統(tǒng)績效管理流程的弊端
在目標與計劃制定階段，一方面缺乏對關(guān)鍵績效指標(kpi)的整體優(yōu)化設(shè)計;另一方面缺乏對單個指標的有效性驗證。
(5)績效計劃制定缺乏依據(jù)，績效目標制定隨意性較大。
績效考核主管沒有及時對下屬進行輔導;績效考核做不到公平公正;績效考核不能很好的應(yīng)用績效考核系統(tǒng);上下級缺乏互動;績效考核指標選擇不當;績效考核信息不準確造成考核救過缺乏可信度。
績效考核應(yīng)為企業(yè)帶來帶來業(yè)績的提升，創(chuàng)造利潤，而不應(yīng)該成為企業(yè)的負擔。